Akaunti ya mfanyabiashara ni akaunti maalum ya benki ya biashara inayowezesha kampuni kukubali na kuchakata malipo ya kielektroniki, kama vile miamala ya kadi za mkopo na za benki. Tofauti na akaunti ya kawaida ya amana, aina hii ya akaunti hutumika kama daraja kati ya mfanyabiashara na taasisi za kifedha zinazohusika katika mtandao wa malipo.
Ili kuendesha akaunti ya mfanyabiashara, biashara lazima iingie katika mkataba rasmi na benki inayopata malipo ya mfanyabiashara (merchant acquiring bank). Benki hii hufanya kazi kama mpatanishi anayewezesha mawasiliano wakati wa mchakato wa malipo, kuhakikisha kuwa fedha zinathibitishwa, kuidhinishwa, na hatimaye kuwekwa kwenye akaunti ya biashara. Uhusiano huu mara nyingi huhusisha ada maalum za huduma na masharti yanayosimamia jinsi miamala inavyoshughulikiwa.
Kwa mfano, muuzaji wa mtandaoni lazima aanzishe akaunti ya mfanyabiashara kwa sababu wateja wake wanaweza kulipa tu kwa kutumia njia za kielektroniki. Wakati mteja anapofanya ununuzi, benki inayopata malipo ya mfanyabiashara huchakata maelezo ya muamala, huwasiliana na mtoaji wa kadi, na kusimamia uhamishaji wa fedha. Wakati maduka ya kawaida yanayokubali pesa taslimu pekee yanaweza kufanya kazi na akaunti ya msingi ya benki, yale yanayotaka kutoa malipo ya kadi yanahitaji ushirikiano huu maalum ili kudhibiti utata wa biashara ya kielektroniki.